年表达了自己的感激之情。但是青年却只是道：“我只是单纯的对解谜这件事感兴趣而已。”这场骚乱到此为止，在此刻彻底的迎来了终结，但是柯南知道，自己心底的混乱还没有得到解决，他必须要搞清楚，福尔摩斯和莫里亚蒂这两个人中，究竞有谁说了谎，又或者是，他们都没有说谎，而是事实本就如此荒谬。“你想知道我和福尔摩斯之间的事？"莫里亚蒂略带惊讶的看向找到自己所在包相的柯南。
“对，请你务必告诉我真相。"柯南面色严肃道。比起没有否认加入了黑衣组织的福尔摩斯，至少目前应该不会对自己做什么的莫里亚蒂，要更为值得信任一点，也即是，从莫里亚蒂这里询问真相，会更安全，即便对方不愿，也不会直接撕破脸。莫里亚蒂做了个邀请的手势，示意柯南坐到自己的对面，然后关好了门。流动着的破碎掉的星星散落在莫里亚蒂的身侧。他看起来神秘且虚幻，就像被虚构出来的角色，而星星错落且有秩序的从下往上，穿过莫里亚蒂的肩膀和肘关节，给人一种他是提线木偶的错觉。“我在追杀他。”
然而他们要聊的话题却注定不会那般美丽，而是盛开在黄昏时分用绚烂晚霞做肥料的枯萎玫瑰。
“我说过我有一位对我而言无比重要的人生导师吧？”柯南点了点头。
“但是福尔摩斯却杀了他。”
“？‖″
柯南因为震惊而久久不能言语。
“因为嫉妒，因为怨恨，而这些，都杀死了我的老师。”莫里亚蒂看向窗外的景色，现在火车经过了一片田野之上，灿烂且充满活力。
“这就是我们之间必须要杀掉对方的原因。不论我在哪，不论他在哪，我们总会相聚在一块。为了最终的决斗。”
莫里亚蒂道。
“而在来到米花町之前，因为我伤到了他，所以他不得不躲藏起来，大概加入黑衣组织也是为了更好的养伤以及更好的躲藏吧，毕竞他知道，在伤没好前就被我找到了的话，结局一定是我赢。我猜到了他的行动，选择留在米花町，这个有黑衣组织成员活动的地方，就是为了透露自己的位置，这样他在伤好后就会主动接近我。”
火车经过了田野，田野被抛在了身后，生命的气息也一并远离。“我们之间的躲猫猫，不是为了活下来，而是为了一个终结。”这些事信息量实在是太大，导致柯南在回去的路上都恍恍惚惚的，他突然撞到了人。
是福尔摩斯。
“他告诉了你真相。”
面前之人的身上有着淡淡的烟味。
他用肯定的语气说道。
“但我想说，真相并不是他所说的那样。”“他只是一个因为无法成为老师最优秀的学生，而因此闹别扭的幼稚可笑的家伙而已，我们之间也因此有了无法回避的矛盾。”“争斗因此而起，悲剧因此上演。”
“你为什么要特地告诉我这些？"柯南问道。面对柯南的问题，青年的嘴角浮现出浅浅的笑意。“你是Ruler(裁定者)啊boy，所以你有权知道这所有的一切。”整个魔法列车的旅行，除却中途发生的命案和爆炸案之外，还是相当不错的，旅途一共有五天四夜，毛利兰和铃木园子都玩的很开心，毛利小五郎也因为能够在火车上品尝到很多高档酒而感到非常的满意，只有柯南，因为莫里亚蒂与福尔摩斯的事一直都处在纠结之中，完全没有心情去享受。黑衣组织原本就很危险，何况现在的黑衣组织还拥有了夏洛克·福尔摩斯。柯南没有意识到的是，这一连串的偶然，已经巧妙的篡改了他潜意识里面的判断，让他逐渐无意识的相信莫里亚蒂与福尔摩斯的身份。而现在困扰他的，则是这二人的立场。
莫里亚蒂说自己是善之一侧的人，但是却与疑似琴酒的男人有接触。福尔摩斯加入了黑衣组织，但是却在爆炸案发生的时候救下了一车的人。还有就是，虽然现在柯南可以确定他们口中的"老师”是真实存在的，但是在这件事上，二人的说法又出现了不一致的地方。莫里亚蒂说，老师只是自己一个人的导师，福尔摩斯是因为嫉妒才要将老师从自己这边夺走，因为在福尔摩斯的人生中缺乏这样一个温柔成熟的人生导师，他也想自己的人生受到指引。福尔摩斯是导致老师死亡的凶手。福尔摩斯说，老师是他与莫里亚蒂共同的老师，是莫里亚蒂想赶走老师身边的其他学生，做老师独一无二的最优秀的学生，所以才会引发矛盾，发生悲剧。罪魁祸首是莫里亚蒂。
在魔法列车的旅行结束后，毛利一行人回到了侦探事务所。毛利兰哼着歌，用手机浏览在火车上拍的照片，还在回味着火车上发生的一切。
虽然火车内部的照片根据林氏集团的要求，现在还不能发到网上，但是自己欣赏是完全没问题的，毛利兰打算等会躺在床上的时候再仔细的看一看。他们按照顺序去洗澡。
轮到柯南的时候，一张纸条从他的口袋掉落。纸条的内容是：你就是工藤新一。
署名：福尔摩斯。
柯南怔怔的站在已经放好了热水的浴缸前，在温暖的浴室内，冒出了一身的冷汗。