（洪武三年七月）升任左丞。
杨宪在皇帝身边时间久了，对典故十分熟悉，却卖弄权势，得到皇帝的宠爱，轻视同僚，没有人敢与他对抗。皇上尚未即位的时候，杨宪曾上书颂扬皇上的功德，趁机劝皇上施行督责之政，来谋求被亲近宠信。皇上说：‘这是想要让我失去人心啊。’朱元璋没有听从他的建议。
杨宪与张昶同在中书省任职，杨宪忌妒张昶的才能超过自己，想要设计陷害他。当时东南地区还没有平定，元朝的政令还在西北通行。张昶曾经在闲暇时对杨宪说：‘我原本是元朝的臣子，勉强留在这儿，心里不能忘记故主，而我的妻儿又都在北方，是死是活都不知道。’杨宪于是抓住他话里的漏洞，诬告张昶谋反，还拿出他亲手写的书信来告发他，张昶于是获罪被诛杀。自此以后，杨宪更加无所忌惮，专权日益严重，他轻视僚属，认为没有人能比得上自己，又喜欢别人对自己阿谀奉承，谋取私利的人大多出自他的门下。
杨宪担任司农卿时，当时浙西刚刚平定，杨宪认为那里的百姓富裕殷实，想要加重赋税来增加国家的收入，就把那里的田亩数量增加了一倍，加倍征收赋税，百姓不堪忍受，都怨恨他。皇上起初不知道这件事。有一个叫陈敦礼的人，是扬州人，擅长诙谐逗趣，称杨宪加赋税为“楦田”（意为虚增田亩）。
杨宪从山西进入中书省（任右丞）时，想要彻底改变中书省的所有事务，将所有的旧官员全部罢免，而改用自己所亲信的人，暗中想要掌握大权，于是他在文书上创造了一个‘一统山河’的花押给官员们看，以此来观察他们是否服从自己。依附自己的人，即使才能平庸也会得到破格提拔。不能提拔的就辞退，人们都不明白他的用意。一天，翰林编修陈??入宫拜见杨宪，杨宪给他看自己的押字，陈??立刻祝贺说：‘押字是大吉之兆，正所谓只有天在上，更无山与齐。’杨宪非常高兴。过了几天，就上奏请求授予陈??为翰林待制，他专横放肆、不守法纪的行为大多像这样。
后来杨宪又刺探丞相汪广洋的隐私，让侍御史刘炳、鄯某等人弹劾他，汪广洋因此被免官，遣返回家乡。杨宪仍然不满足，让刘炳上奏请求把汪广洋迁到海南，皇上没有听从，杨宪又教唆刘炳诬告刑部侍郎左安善诬陷他人，皇上才发觉他们的诬告，将刘炳打入狱中，刘炳不能隐瞒，就把实情全部说了出来。太史令刘基也揭发了杨宪的奸邪行为和其他暗中做的事。皇帝非常生气，命令群臣审讯，杨宪认罪，于是和刘炳等人都被诛杀。
皇上查看内库，感慨地对臣子们说：‘这些都是百姓的劳力所供奉的，积蓄起来是为天下所用的，我怎么敢私自占有呢？如果奢侈且胡乱花费，追求个人的欢娱，竭尽声色方面的享乐，这是把天下的积蓄作为自己一人的奉养。现在天下已经平定，国家没有战事，除了封赏之外，正应该勤俭节约，来减省不必要的开支。
大明太祖圣神文武钦明启运俊德成功统天大孝高皇帝实录卷之五十四