平反，不合祀典的祠庙，他都下令废除。听说元佑党人的碑在融州的山谷中，就去把它捣碎了。等到他改任彭州知州，对百姓们慰勉安抚，亲自教导百姓耕种，由于元末战乱饥荒，百姓暴尸荒野，他把尸骨都聚集起来埋葬了。都江的各个堰堤，从秦朝时开始建造，把江水分开来灌溉成都的农田，历代都用铁石修筑，耗费了大量的人力和物力。春夏之交河水暴涨，堤岸经常被冲毁。元朝末年战乱，水利设施无人管理，百姓无法利用水利。子祺建议修筑，只用竹子和木头，修成后，节省了费用，获利丰厚，百姓感到非常便利。到这时，他升任延平府知府，过了一年，因为生病在任上去世。
己丑日，朱元璋下令告诉大将军徐达等人说：‘六月四日早上，金星侵犯毕宿右股北第一颗星，预示着夷狄会起兵。按照分野来推断，应该是在赵地。现在原来的元四大王手下不足二百人，官军多次追捕都没有抓获（他们）。之前（他们）都说那些人没有马匹，现在却又说有十五个骑马的人（在这一带）出没，不知道（这些马匹）是被什么人劫夺的，大概是由于你们这些将领不乘机剿灭追捕（他们），才导致这样（的情况）。敕令一到，迅速派遣有智谋、有勇力的将士从四面进行搜捕，不要使（他们）蔓延开来。大同、岢岚等地，也命令防守的官军严密地做好防御准备。
将中书舍人王辉、任敬、赵观、陈宝、李云提升为监察御史。
任命宋璲、陶永为中书舍人。宋璲，是翰林学士承旨宋濂的儿子。永，是晋王府右相王凯的儿子。
辛卯日，提拔济南府德州知州张瑛等三百四十三人担任南昌府知府以下官职，这些人都是因为考核成绩优异而被提拔的。
壬辰日，浙江省的大臣奏报说：杭州府的钱塘、仁和、余杭三个县发大水，地势低洼的农田被水淹没的有九十五顷。皇帝下诏书派遣国子生田龄等人前往查验这件事。
大都督府同知何文辉去世。何文辉，字德明，是滁州人。朝廷的军队攻取滁州时，俘获了文辉，他当时才十四岁，皇上喜爱他，像对待自己的儿子们一样抚养教育他。长大以后，因为有才能被任命为总制，后来又被升为天宁翼元帅。皇上与陈友谅在鄱阳湖交战，何文辉在军中效力，因为战功升为同知南昌卫指挥使司事，守卫南昌。不久后他晋升为江西行省参政，转任左丞。他以征南副将军的身份平定福建，被征召返回京城，随从皇帝到北方巡视。等到攻取河南后，又被授予河南卫指挥使官职，受命镇守潼关。跟随大军在定西作战，打败了元扩廓帖木儿的军队，代理安西分都督府的事务，被加封镇国将军、大都督府佥事。跟随颍川侯傅友德攻打成都，率军戍守，被提升为大都督府同知。洪武五年，曹国公李文忠向北出征和林，文辉督率军队巡视居庸关，突然生病返回，在家中去世，年仅三十六岁。皇上为他感到悲痛惋惜，命令有关部门处理丧事，用官府的礼仪和物品来安葬他。
甲午日。皇帝下诏将行中书省改为承宣布政使司，设置布政使一名，为正二品官员，左右参政各一名，为从二品官员。将左右司改为经历司，设置经历一人，为从六品；都事、检校各一人，为从七品；照磨、管勾各一人，为从八品；理问所设正理问，为正六品；副理问，为从七品；提控案牍（一人）。
任命监察御史萧韶、秦王府伴读魏肃担任北平布政使司的参政，司文监丞王琏、监察御史彭通担任山西布政使司的参政，晋王府伴读王铎、中书舍人王澍担任浙江布政使司的参政，考功监丞马亮担任河南布政使司的参政。皇帝下令让监令张迥、监丞杨正、司文监丞王称、给事中平晢担任监察御史，让儒士王佐担任给事中。
乙未这天，莒州日照县的知县马亮任职期满进京朝见君主，莒州呈上他的考核结果说：（他）没有督促农事、兴办教育的成绩，却擅长监督运输事务。吏部将此事上报给了皇帝。皇上说：“农业和蚕桑业是衣食的根本，学校是风俗教化的源头，这些都是太守和县令首先要做的事务。”不知道致力于这些（重要事务），却称擅长督运（物资），这是舍弃根本而致力于细枝末节，难道是他的职责所在吗？如果只知道一味地惩罚，以此来显示自己的能力，这并不是平易近人的政事。做县令却没有和乐平易的心，百姓受到的祸患就会很多。应该贬官降职（处罚）他们，使他们有所警戒。
丙申日，任命开封府知府王博为户部尚书。设置尚履局。
丁酉日，出现了白虹。
己亥日，重新修建的奉先殿竣工。起初，皇上认为奉先殿不相称，下令重新建造它，到这时才建成，安放好四位先皇的牌位，用牲醴祭祀禀告先皇。
庚子日，任命内侍宗亮等七十四人担任司香、尚冠、尚衣等职务。
辛丑日。征虏前将军曹国公李文忠从北平回来，上交了他的印绶。
礼部说：“凡是在殿庭颁布诏书册命，应该从中间的门道出